クレメンツ鳥類分類体系によれば、ヒクイドリ目の下に、ヒクイドリ科とエミュー科が位置します。 シブリー・アールキスト鳥類分類体系によれば、ダチョウ目の下に、ダチョウ科、レア科、ヒクイドリ科、キーウィ科が位置します。 シブリー・アールキスト鳥類分類体系はDNAレベルで分類しているので正確だと思われますが、まだ主流となっているわけではないようです。主流の分類体系は、クレメンツ鳥類分類体系のようです。